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Super Virus: Deux variants ont fusionné et les scientifiques craignent une nouvelle pandémie

Les variantes britanniques et californiennes du coronavirus semblent s’être combinées en un hybride fortement muté, ce qui suscite des inquiétudes quant au fait que nous pourrions entrer dans une nouvelle phase de la pandémie de covid-19

Deux variantes du coronavirus SARS-CoV-2 à l’origine du covid-19 ont combiné leurs génomes pour former une version hybride fortement mutée du virus. L’événement de «recombinaison» a été découvert dans un échantillon de virus en Californie, provoquant des avertissements selon lesquels nous pourrions être sur le point d’entrer dans une nouvelle phase de la pandémie.

Le virus hybride est le résultat de la recombinaison du variant B.1.1.7 hautement transmissible découvert au Royaume-Uni et du variant B.1.429 originaire de Californie et qui pourrait être responsable d’une récente vague de cas à Los Angeles car il porte un mutation la rendant résistante à certains anticorps.

Le recombinant a été découvert par Bette Korber au Los Alamos National Laboratory au Nouveau-Mexique, qui a déclaré lors d’une réunion organisée par l’ Académie des sciences de New York le 2 février qu’elle en avait vu des preuves «assez claires» dans sa base de données de génomes viraux américains. .

S’il était confirmé, le recombinant serait le premier à être détecté dans cette pandémie. En décembre et janvier, deux groupes de recherche ont indépendamment rapporté qu’ils  n’avaient vu aucune preuve de recombinaison , même si elle était attendue depuis longtemps car elle est courante dans les coronavirus.

Contrairement à la mutation régulière, où les changements s’accumulent un à la fois, c’est ainsi que des variantes telles que B.1.1.7 sont apparues, la recombinaison peut rassembler plusieurs mutations en une seule fois. La plupart du temps, ceux-ci ne confèrent aucun avantage au virus, mais ils le font parfois.

La recombinaison peut avoir une importance évolutive majeure, selon François Balloux de l’University College London. Il est considéré par beaucoup comme l’origine du SRAS-CoV-2.

La recombinaison pourrait conduire à l’émergence de nouvelles variantes encore plus dangereuses , bien que l’on ne sache pas encore à quel point ce premier événement de recombinaison pourrait représenter une menace.

Korber n’a vu qu’un seul génome recombinant parmi des milliers de séquences et il n’est pas clair si le virus se transmet de personne à personne ou s’il n’est qu’un seul.

La recombinaison se produit généralement dans les coronavirus parce que l’enzyme qui réplique leur génome a tendance à glisser du brin d’ARN qu’elle copie, puis à rejoindre là où elle s’est arrêtée. Si une cellule hôte contient deux génomes de coronavirus différents, l’enzyme peut sauter à plusieurs reprises de l’un à l’autre, combinant différents éléments de chaque génome pour créer un virus hybride.

L’émergence récente de plusieurs variantes du nouveau coronavirus a peut-être créé la matière première pour la recombinaison, car les gens peuvent être infectés par deux variantes différentes à la fois.

«Nous arrivons peut-être au point où cela se produit à des rythmes appréciables», déclare Sergei Pond de l’Université Temple en Pennsylvanie, qui surveille les recombinants en comparant des milliers de séquences génomiques téléchargées dans des bases de données. Il dit qu’il n’y a toujours aucune preuve de recombinaison généralisée, mais que «les coronavirus se recombinent tous, donc c’est une question de quand, pas si».

Les implications de cette découverte ne sont pas encore claires car on en sait très peu sur la biologie du recombinant. Cependant, il porte une mutation de B.1.1.7, appelée Δ69 / 70, qui rend le virus UK plus transmissible, et une autre de B.1.429, appelée L452R, qui peut conférer une résistance aux anticorps.

« Ce genre d’événement pourrait permettre au virus d’avoir couplé un virus plus infectieux avec un virus plus résistant », a déclaré Korber lors de la réunion de New York.

Lucy van Dorp de l’University College London dit qu’elle n’avait pas encore entendu parler du recombinant, mais «ne serait pas trop surprise si certains cas commencent à être détectés».

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Source : News Scientifist

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